耶氏肺孢子菌肺炎
Chapter 01：疾病簡介
耶氏肺孢子菌肺炎(Pneumocystis Jiroveci Pneumonia, PJP)，是由耶氏肺孢子菌引起的(de)一種真菌感染性疾病，是臨床艾滋病(HIV)患者中最常見的(de)疾病，也(yě)是免疫缺陷病患者死亡的(de)重要原因之一。
一般來說，耶氏肺孢子菌爲條件(jiàn)緻病菌，免疫力正常的(de)人(rén)群幾乎不會(huì)感染肺孢子菌，隻有(yǒu)免疫缺陷時才會(huì)被感染，從而表現出一系列症狀。
臨床表現：耶氏肺孢子菌肺炎多爲突然的(de)發熱(rè)、咳嗽及呼吸困難，逐漸加重，可(kě)伴有(yǒu)其他(tā)非特異性的(de)症狀，如(rú)乏力、腹瀉、消瘦等。影像學雙肺呈彌漫性網狀、小(xiǎo)結節間質性浸潤征象，但(dàn)需注意的(de)是10%~39% 的(de)早期患者胸片會(huì)表現爲正常或接近正常。
圖片來源于騰訊醫典
易感人(rén)群：耶氏肺孢子菌在兒童、孕婦、無基礎免疫抑制(zhì)人(rén)群(低載量)、慢(màn)性疾病患者中定植，易感人(rén)群主要分(fēn)爲兩類，一類爲HIV患者(CD4+T細胞計(jì)數≤ 200/μl)，另一類爲非HIV感染免疫力低下患者，其中包括實體瘤或血液系統惡性腫瘤患者；免疫抑制(zhì)治療患者；器(qì)官移植受者；CMV感染患者等。
檢測方法：包括血液學檢查、血清學檢查、動脈血氣分(fēn)析和(hé)肺功能(néng)、病原學檢查和(hé)胸部CT檢查等。但(dàn)耶氏肺孢子菌分(fēn)滋養體和(hé)包囊，包囊靠空氣傳播，繁殖緩慢(màn)，臨床上(shàng)很難培養，陽性率較低，也(yě)不能(néng)直接精準定位到(dào)緻病病原體。
因此，基于宏基因組測序(mNGS)和(hé)多重靶向測序(tNGS)的(de)多種優點，這兩種測序技術(shù)在臨床應用(yòng)也(yě)越來越廣泛。
治療方法：以“複方磺胺甲惡唑片”爲基礎用(yòng)藥，可(kě)聯合使用(yòng)其他(tā)抗真菌藥物(wù)。對重症患者推薦使用(yòng)激素，必要時需應用(yòng)呼吸機輔助治療。
但(dàn)該病發病率高(gāo)，恢複性差，非HIV感染人(rén)群恢複性更差，目前臨床工(gōng)作主要以預防爲主。
預防措施：
（1）注意免疫抑制(zhì)者與患者的(de)隔離(lí)，防止交叉感染。
（2）對高(gāo)危人(rén)群應密切注意觀察。
（3）對有(yǒu)發生耶氏孢子蟲感染危險的(de)病人(rén)，應用(yòng)藥物(wù)預防，可(kě)有(yǒu)效地(dì)防止潛在感染轉變爲臨床疾病和(hé)治療後複發。
Chapter 02：美(měi)格醫學病例報告
1、黃(huáng)XX：男，25歲。
臨床症狀：發熱(rè)、咳嗽，血氧下降，已經上(shàng)呼吸機。
臨床确診：急性淋巴細胞性白血病 9 月(yuè)餘，急性淋巴細胞白血病骨髓移植術(shù)後半年。
mNGS檢測前用(yòng)藥：亞胺培南西(xī)司他(tā)丁鈉、米卡芬淨鈉、更昔洛韋。
2021年10月(yuè)18日，mNGS送檢，患者樣本類型爲肺泡灌洗液，檢測結果符合臨床預期。
mNGS檢測結果如(rú)下圖：
2、楊XX：女(nǚ)，45歲。
臨床症狀：咳嗽。
臨床初步診斷：結合臨床檢測，提示肺部感染，雙肺彌漫，腎移植狀态，重點懷疑耶氏肺孢子菌感染。
2021年10月(yuè)19日，mNGS和(hé)tNGS送檢，患者樣本類型爲肺泡灌洗液。檢測結果符合臨床預期，後轉用(yòng)複方磺胺甲惡唑片，有(yǒu)好轉。
mNGS檢測結果如(rú)下圖：
tNGS檢測結果如(rú)下圖：
3、餘X：男，29歲。
臨床症狀：發熱(rè)、氣促。
臨床初步診斷：結合臨床檢測，提示肺部感染，懷疑急性淋巴細胞性白血病。
mNGS檢測前用(yòng)藥：哌拉西(xī)林他(tā)唑巴坦。
2021年10月(yuè)20日，mNGS和(hé)tNGS送檢，患者樣本類型爲肺泡灌洗液。檢測結果符合臨床預期，轉用(yòng)抗真菌藥，好轉，已痊愈出院。
mNGS檢測結果如(rú)下圖：
tNGS檢測結果如(rú)下圖：
Chapter 03：美(měi)格醫學mNGS和(hé)tNGS簡介
美(měi)格醫學mNGS：
美(měi)格醫學mNGS不依賴于傳統的(de)微生物(wù)培養，無需預設，直接對臨床樣本中的(de)核酸進行(xíng)高(gāo)通量測序，數據庫約有(yǒu)60萬+株微生物(wù)參考基因組，可(kě)精确鑒定到(dào)的(de)微生物(wù)種類就達23796種。
采用(yòng)Illumina Nextseq 550儀器(qì)測定，耗時短，數據質量高(gāo)，Q30＞90%，且具有(yǒu)個(gè)性化核酸提取方案，DNA、RNA病原雙流程檢測，可(kě)常溫保存和(hé)運輸等優點，可(kě)爲臨床精準定位緻病病原體提供很大(dà)的(de)便利。
美(měi)格醫學tNGS：
美(měi)格醫學tNGS是基于超多重PCR和(hé)二代測序技術(shù)的(de)新型病原微生物(wù)檢測方法，包括有(yǒu)基礎版、升級版、高(gāo)級版和(hé)分(fēn)枝杆菌版四個(gè)版本的(de)特定病原體檢測。
tNGS對比于mNGS，tNGS解決了mNGS受人(rén)源基因組及背景菌基因組幹擾的(de)問題、解決了mNGS對結核、真菌、胞内菌等檢出率低的(de)問題、解決了mNGS對RNA病毒檢測難度大(dà)的(de)問題、并且能(néng)同時對特定物(wù)種的(de)耐藥基因及毒力因子基因進行(xíng)分(fēn)析。
